由於控制棒能夠吸收中子，因此可以避免爐心內的鈾原料產生持續擴大的中子連鎖反應。因此利用控制棒的插入或拔出反應器核心，能夠使得核裂變過程保持穩定；譬如說：核能電廠停機時控制棒整個插入爐心，吸收絕大部份的中子；電廠要開始起動時，控制棒要先慢慢抽出來，直到爐心達到穩定的裂變狀態時再將控制棒固定；而當有臨時緊急狀況或異常現象發生時，控制棒就會像汽車的煞車一樣，迅速地被插入爐心，停止其分裂反應，以避免發生意外。