其實，是因為以顯性存在的疾病因子，因為極容易顯現在性狀上，使得帶因的個體很容易就死亡或成為生殖上的弱勢，反而很容易在漫漫的演化歷史中被淘汰，只剩下隱性的疾病基因，可以「潛伏」在染色體中被保存下來。由於近親的基因相似度高，攜帶有同型的隱性不良基因的機率較高；就算交配的兩者都健康，為Aa，他們生下帶病的aa的機率就有1/4。

２．並非其他動物都可近親交配：有些動物的生活型態不同，或是族群的專一性需要極高　(意思就是說：族群中大家都要長得一樣或很像)，的確都是近親交配，例如像：榕果小蜂等

但許多演化較高等，或歧異度較高的動物，在整個族群的生殖策略或是行為上，自然而然就會避免近親交配；如許多鳥類的幼鳥長成成鳥時，母鳥或公鳥會有播遷到其他族群的領域的行為；行家族群居生活的雄黑猩猩，大部分自然地會避免向母親或手足求偶。

許多動物因為人類活動範圍的擴大，造成棲地縮小、族群變小，不得已的近親交配結果，也讓族群更趨衰弱、歧異度變小。